Lesy Hluboká, akciová společnost vznikla 1.10.1992 transformací Jihočeských Státních lesů České Budějovice ve druhé vlně kupónové privatizace. Původním majitelem akciové společnosti byl FNM. Od roku 1994 do roku 1998 se o významné akcionářské podíly dělily různé právnické osoby, které zde uplatňovaly svůj vliv na řízení společnosti. V průběhu roku 1998 nabyla rozhodující balík akcií společnost Ekofidas s.r.o.
V roce 1999 bylo rozhodnuto o převedení podnikatelských aktivit na dceřinou společnost Lesy Hluboká nad Vltavou a.s., která je v současnosti nositelkou lesnických i mysliveckých tradic v Hluboké nad Vltavou.